29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0625 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  64.62 
 
 		 195 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  63.08 
 
 		 195 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  54.59 
 
 		 215 aa  207  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  47.09 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  47.09 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  44.44 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  40.22 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  43.78 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  42.29 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  42.61 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  44 
 
 		 243 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  40.21 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  41.44 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  37.7 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  41.86 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  39.69 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  34.38 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  36.87 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  34.29 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  35.8 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  34.12 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  31.87 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  29.51 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  28.48 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  27.6 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  26.42 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>