24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0215 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  100 
 
 		 366 aa  728    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  34.44 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  33.33 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  29.73 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  30.11 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.22 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  28.51 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  32.45 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  28.57 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  26.92 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.03 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  23.78 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.94 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  26.06 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  31.4 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.58 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  27.6 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  30 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  48.98 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00190  hypothetical protein  34.13 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  25.71 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  31.82 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  32.04 
 
 		 298 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>