13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1381 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1381  PilX protein  100 
 
 		 173 aa  353  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  55.86 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1766  fimbrial assembly protein  36.78 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.132281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1704  PilX protein  33.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  45.45 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  47.83 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  44.83 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  37.1 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  26.38 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  36.07 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  35.9 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  35.59 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  45.83 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>