79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0893 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  46.15 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  46.15 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  46.15 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  46.15 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  35.64 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  34.2 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  34.55 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  35.91 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  36.46 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  36.22 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  36.98 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  36.98 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  34.92 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  33.16 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  35 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  34.21 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  33.86 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  34.9 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  32.53 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  33.16 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  34.2 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  32.45 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  32.22 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  32.22 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  33.33 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  33.12 
 
 		 217 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  34.48 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  30.43 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  34.76 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  29.95 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  32.74 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  27.23 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  28.25 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  31.54 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  30.87 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  32.24 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  31.61 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  30.6 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  31.95 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  27.72 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  28.73 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  28.73 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  27.62 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  33.91 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  32.17 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  49.15 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  46.15 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  46.15 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  27.86 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  22.78 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 		 596 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  23.79 
 
 		 596 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  29 
 
 		 125 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  35.58 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  27.16 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  27.04 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  26.42 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.07 
 
 		 599 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2522  phage baseplate assembly protein V  37.66 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  28.39 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1046  phage baseplate assembly protein V  27.52 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  25.22 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  32.61 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  36.25 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  36.23 
 
 		 499 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  23.5 
 
 		 598 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  27.78 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  36.84 
 
 		 218 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  26.67 
 
 		 595 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  24.24 
 
 		 704 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0743  bacteriophage Mu Gp45 protein  26.34 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0694  bacteriophage Mu Gp45 protein  26.34 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  27.71 
 
 		 605 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  24.06 
 
 		 596 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>