26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6404 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6404  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
399 aa  825    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.598711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3848  hypothetical protein  28.73 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2460  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  31.29 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0831  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1081  hypothetical protein  23.56 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  23.98 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  26.03 
 
 
364 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0864  glycosyltransferase related  27.44 
 
 
385 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.134374  normal  0.0749108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
419 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
823 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3783  hypothetical protein  24.58 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  20.93 
 
 
437 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  20.93 
 
 
437 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
655 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
395 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>