23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5874 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5874  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  44 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  38.3 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  40.51 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  37.87 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  37.13 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  33.76 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  27.84 
 
 		 336 aa  49.7  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 343 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  25 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  25.3 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1353  hypothetical protein  27.69 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.407109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1364  hypothetical protein  26.39 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1360  hypothetical protein  25.69 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  24.02 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0589  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  25.97 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0488742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  24.4 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  24.4 
 
 		 258 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>