19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5341 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5341  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3570  hypothetical protein  45.8 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6202  hypothetical protein  36.49 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.442232  normal  0.210434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2915  hypothetical protein  29.62 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00698694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2179  hypothetical protein  23.65 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4390  hypothetical protein  27.4 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0337176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0618  hypothetical protein  25.17 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.227452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2828  hypothetical protein  27.03 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2552  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.767139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0151  hypothetical protein  24.18 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09763  hypothetical protein  24.81 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.138085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0031  hypothetical protein  26.89 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2063  hypothetical protein  31.88 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6409  hypothetical protein  26.26 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1589  hypothetical protein  26.46 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1435  hypothetical protein  30.6 
 
 		 391 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08736  hypothetical protein  28.65 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3694  hypothetical protein  27.52 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1226  hypothetical protein  28.77 
 
 		 371 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.306759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>