19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0031 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0031  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2828  hypothetical protein  31.7 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2915  hypothetical protein  30.43 
 
 
345 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00698694  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4402  hypothetical protein  26.46 
 
 
376 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4403  hypothetical protein  27.54 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1226  hypothetical protein  26.84 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.306759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4390  hypothetical protein  24.27 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0337176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0151  hypothetical protein  25.17 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1437  hypothetical protein  23.89 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3570  hypothetical protein  28.76 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2552  hypothetical protein  29.07 
 
 
260 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.767139  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08736  hypothetical protein  23.17 
 
 
420 aa  59.7  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1435  hypothetical protein  24.53 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6409  hypothetical protein  30.29 
 
 
270 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5341  hypothetical protein  26.89 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2179  hypothetical protein  23.2 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2063  hypothetical protein  25.26 
 
 
273 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09763  hypothetical protein  21.33 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.138085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1436  hypothetical protein  22.41 
 
 
397 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>