15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09763 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09763  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.138085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2179  hypothetical protein  39.56 
 
 
273 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2063  hypothetical protein  39.93 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0151  hypothetical protein  37.17 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1589  hypothetical protein  29.35 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3570  hypothetical protein  23.49 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2552  hypothetical protein  27.34 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.767139  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3694  hypothetical protein  25.91 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000624309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5341  hypothetical protein  24.2 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4390  hypothetical protein  21.93 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0337176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0618  hypothetical protein  24.01 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.227452  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6409  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0031  hypothetical protein  23.03 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6202  hypothetical protein  22.59 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.442232  normal  0.210434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1226  hypothetical protein  20.93 
 
 
371 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.306759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>