16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2063 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2179  hypothetical protein  41.61 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0151  hypothetical protein  45.65 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09763  hypothetical protein  41.02 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.138085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1589  hypothetical protein  33 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3570  hypothetical protein  26.47 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2552  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.767139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3694  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4390  hypothetical protein  27.17 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0337176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6409  hypothetical protein  27.21 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5341  hypothetical protein  31.88 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0256  hypothetical protein  26.97 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0618  hypothetical protein  21.68 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.227452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1226  hypothetical protein  25.41 
 
 		 371 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.306759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0031  hypothetical protein  25.26 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6202  hypothetical protein  23.13 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.442232  normal  0.210434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>