16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6409 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6409  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3694  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2552  hypothetical protein  35.32 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.767139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4390  hypothetical protein  34.34 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0337176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2179  hypothetical protein  29.14 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0151  hypothetical protein  25.48 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2063  hypothetical protein  27.56 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0031  hypothetical protein  30.29 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5341  hypothetical protein  26.26 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09763  hypothetical protein  25.82 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.138085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5732  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193719  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3570  hypothetical protein  23.65 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1589  hypothetical protein  25.61 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0618  hypothetical protein  24.56 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.227452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08736  hypothetical protein  26.22 
 
 		 420 aa  45.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1697  hypothetical protein  23.16 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>