13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2828 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2915  hypothetical protein  33.52 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00698694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0031  hypothetical protein  31.7 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1226  hypothetical protein  26.5 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.306759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4402  hypothetical protein  26.28 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4403  hypothetical protein  24.67 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1435  hypothetical protein  23.46 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1437  hypothetical protein  22.68 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5341  hypothetical protein  27.03 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3570  hypothetical protein  25.08 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08736  hypothetical protein  20.5 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1436  hypothetical protein  30 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2552  hypothetical protein  23.77 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.767139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>