30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4704 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
1060 aa  2197    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.82 
 
 
1042 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  31.58 
 
 
1038 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  31.52 
 
 
1055 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.07 
 
 
1036 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.56 
 
 
1148 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.65 
 
 
1013 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  31.59 
 
 
757 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  37.02 
 
 
317 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.43 
 
 
1066 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  23.26 
 
 
1029 aa  107  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  23 
 
 
987 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.18 
 
 
1009 aa  104  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  26.51 
 
 
1074 aa  102  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.27 
 
 
968 aa  97.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.28 
 
 
964 aa  90.1  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.73 
 
 
1035 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  22.78 
 
 
1027 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  21.67 
 
 
1021 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.41 
 
 
1042 aa  82.4  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.11 
 
 
915 aa  71.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  22.78 
 
 
1031 aa  69.3  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.71 
 
 
729 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  32.81 
 
 
373 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.15 
 
 
916 aa  55.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.41 
 
 
919 aa  53.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.17 
 
 
904 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4205  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.58 
 
 
937 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.254357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0550  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.45 
 
 
858 aa  46.2  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13765  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4231  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.92 
 
 
962 aa  44.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>