26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4692 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1504    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  40.61 
 
 		 702 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  39.49 
 
 		 704 aa  555  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  38.99 
 
 		 705 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  37.25 
 
 		 744 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  29.2 
 
 		 773 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  27.47 
 
 		 770 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  24.84 
 
 		 754 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  23.5 
 
 		 718 aa  144  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  23.62 
 
 		 690 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  25.53 
 
 		 557 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  22.8 
 
 		 675 aa  120  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  23.42 
 
 		 685 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  22.59 
 
 		 682 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  21.56 
 
 		 715 aa  87.8  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  21.79 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  20.61 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  26.32 
 
 		 830 aa  52  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0932  hypothetical protein  25.81 
 
 		 631 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  decreased coverage  0.000145164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0182  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1440 aa  48.5  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  30.53 
 
 		 693 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 701 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  22.33 
 
 		 687 aa  44.3  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  35.82 
 
 		 686 aa  44.3  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5142  hypothetical protein  20.16 
 
 		 690 aa  44.3  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>