17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3849 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 526 aa  1085    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  42.91 
 
 		 535 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  40.73 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4326  hypothetical protein  31.83 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  28.64 
 
 		 1771 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2252  hypothetical protein  27.15 
 
 		 695 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2615  hypothetical protein  25.12 
 
 		 470 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3463  parallel beta-helix repeat protein  25.49 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5860  hypothetical protein  25.14 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2487  parallel beta-helix repeat protein  25.28 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.67625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  24.1 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  29.33 
 
 		 693 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  39.39 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3092  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.03 
 
 		 491 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.573715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  34.57 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  33.01 
 
 		 5453 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  38.1 
 
 		 743 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>