More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3791 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
867 aa  1772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0584579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  30.07 
 
 
2894 aa  264  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.09 
 
 
1160 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2667  peptide synthetase-domain-containing protein  32.93 
 
 
630 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  32.05 
 
 
2125 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2140  peptide synthetase-domain-containing protein  33.2 
 
 
633 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  32.93 
 
 
612 aa  212  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1638  peptide synthetase-domain-containing protein  32.93 
 
 
612 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2525  amino acid adenylation domain-containing protein  33.2 
 
 
633 aa  212  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1415  peptide synthetase-domain-containing protein  32.93 
 
 
612 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3173  peptide synthetase-domain-containing protein  32.93 
 
 
612 aa  212  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
634 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.811397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1953  peptide synthetase-domain-containing protein  32.38 
 
 
612 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.92 
 
 
2439 aa  209  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  30.13 
 
 
5654 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.04 
 
 
4196 aa  204  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  29.14 
 
 
2419 aa  204  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  28.33 
 
 
1569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  29.43 
 
 
1574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 
1130 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  31.68 
 
 
5469 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  31.17 
 
 
4318 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  28.2 
 
 
1336 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.68 
 
 
3086 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.39 
 
 
1839 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  29.51 
 
 
2596 aa  197  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.68 
 
 
3086 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  25.64 
 
 
888 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  28.98 
 
 
625 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 
1689 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  31.08 
 
 
2845 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  29.5 
 
 
3208 aa  195  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.09 
 
 
6889 aa  194  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  29.61 
 
 
1174 aa  194  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 
1304 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  28.55 
 
 
2258 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.38 
 
 
8646 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.68 
 
 
2883 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  28.55 
 
 
5372 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  28.37 
 
 
2791 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  29.03 
 
 
1142 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  30.2 
 
 
627 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  31.25 
 
 
2896 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.64 
 
 
2867 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.12 
 
 
2370 aa  191  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  31.02 
 
 
1153 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  29.86 
 
 
1753 aa  191  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.34 
 
 
13537 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.67 
 
 
4991 aa  191  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.75 
 
 
7310 aa  190  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  31.76 
 
 
3942 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  31.85 
 
 
3231 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  29.62 
 
 
1556 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 
3231 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 
1553 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  29.62 
 
 
1556 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.34 
 
 
5953 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
5596 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  28.4 
 
 
2164 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  31.72 
 
 
3221 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  29.17 
 
 
9498 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  27.45 
 
 
2387 aa  188  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.04 
 
 
5929 aa  188  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  28.13 
 
 
1786 aa  187  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  28.9 
 
 
1084 aa  187  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  30.91 
 
 
1153 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  31.23 
 
 
2350 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  28.62 
 
 
4336 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  31.32 
 
 
3219 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  28.7 
 
 
4317 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  29.48 
 
 
2154 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  29.04 
 
 
3352 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  29.04 
 
 
3328 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  29.58 
 
 
4502 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  26.8 
 
 
1470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  31.27 
 
 
3227 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  24.3 
 
 
1922 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  26.8 
 
 
1470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  29.04 
 
 
6006 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.58 
 
 
6676 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  29.04 
 
 
6081 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  26.55 
 
 
1449 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.07 
 
 
2666 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 
7712 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  29.04 
 
 
6072 aa  184  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.21 
 
 
6176 aa  184  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.75 
 
 
3695 aa  183  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.42 
 
 
5926 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  26.59 
 
 
1331 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  30.96 
 
 
3227 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  31.72 
 
 
3224 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  27.29 
 
 
1093 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  28.43 
 
 
4572 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.02 
 
 
2054 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  30.69 
 
 
3180 aa  183  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  27.12 
 
 
1145 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  27.7 
 
 
1069 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  29.61 
 
 
5422 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  29.18 
 
 
2448 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.94 
 
 
5213 aa  182  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>