30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2534 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  100 
 
 
241 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  45.31 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  44 
 
 
263 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  42.19 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  42.24 
 
 
231 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  34.05 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
235 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  25.4 
 
 
236 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  27.69 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  29.86 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  27.31 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  26.67 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  26.52 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  24.9 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  22.27 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  21.74 
 
 
221 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  26.44 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  26.27 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  24.05 
 
 
299 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  25 
 
 
311 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>