25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0756 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  283  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  30.43 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  34.52 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  33.67 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  34.52 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  31.82 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  31.46 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  37.29 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  36.78 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  35.16 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  32.39 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  33.87 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  36.78 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  35.62 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  35.62 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  29.55 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  29 
 
 		 133 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  46.15 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  25.81 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  30.21 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>