22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  100 
 
 
614 aa  1178    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  58.5 
 
 
578 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  53.02 
 
 
697 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  47.4 
 
 
888 aa  143  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  47.97 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0554  Forkhead-associated protein  51.35 
 
 
377 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.965875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  47.83 
 
 
534 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05600  FHA domain-containing protein  46.43 
 
 
502 aa  94  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.3344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  47.62 
 
 
564 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  37.66 
 
 
334 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  36.94 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  43.52 
 
 
424 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1473  Forkhead-associated protein  32.65 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0144762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3941  forkhead-associated protein  38.66 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
598 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  29.68 
 
 
498 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  27.04 
 
 
446 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  32.73 
 
 
668 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  48.98 
 
 
245 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  29.2 
 
 
556 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  31.03 
 
 
325 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>