28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  61.11 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  64.71 
 
 		 120 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  65.32 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  64.41 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  67.23 
 
 		 120 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  61.86 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  62.18 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  64.41 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  63.03 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  61.86 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  44.83 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  32.14 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  40.18 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  28.7 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  36.61 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  31.37 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  35 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  29.09 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  32.69 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  30.36 
 
 		 272 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  29.09 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  31.31 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  31.76 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  25.74 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>