195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  94.55 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0077  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0027  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0032  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0214663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0053  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0028  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0014  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0035  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0028  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0050  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0043  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0060  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0020  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0041  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.018808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0021  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0012  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  0.23369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0052  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.307306  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0028  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  hitchhiker  0.002006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0043  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0035  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0022  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.983676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0014  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0022  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0007  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0042  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0080  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0067  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0634109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0036  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0071  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0012  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.430923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0020  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0027  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0033  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.715295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0041  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0102  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00845186  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  84.38 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4315  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0699439  normal  0.201928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0289  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0256101  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0273  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0036281  normal  0.436112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0020  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00394718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0092  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00539323  decreased coverage  0.00141538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0103  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00507683  decreased coverage  0.00339417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0006  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0108839  normal  0.0634944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0119  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000630461  hitchhiker  0.0000581532 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>