59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2628 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  333  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  99.4 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  98.8 
 
 		 166 aa  330  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  93.37 
 
 		 166 aa  320  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  91.57 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  91.57 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  91.57 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  91.57 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  87.95 
 
 		 166 aa  308  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  77.11 
 
 		 168 aa  276  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  72.89 
 
 		 166 aa  255  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  72.89 
 
 		 168 aa  237  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.88 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  65.85 
 
 		 164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.67 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.88 
 
 		 166 aa  221  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  34.55 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.15 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  32.54 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 171 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  33.94 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  33.72 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  34.78 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.55 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  31.14 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  34.57 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.07 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  32.3 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  33.14 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  28.83 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  27.61 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.58 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.48 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  30.91 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  26.95 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  26.43 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  28.85 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  25.31 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.38 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  21.69 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.29 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.57 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.91 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  25.55 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  27.14 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.82 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  22.64 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  26.92 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  25.43 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  22.64 
 
 		 170 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1510  amino acid-binding ACT domain protein  25 
 
 		 186 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0143098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.92 
 
 		 188 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  24.43 
 
 		 1319 aa  41.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  24.39 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00127  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.84 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0355979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>