38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3319 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3319  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.20092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0634  hypothetical protein  99.35 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3192  hypothetical protein  80.92 
 
 		 153 aa  256  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0797  hypothetical protein  87.58 
 
 		 153 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  27.12 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  26.67 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  26.67 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  24.58 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  25.74 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  25.74 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  25.74 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  25.74 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  25.19 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  25.74 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  25.74 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  25.81 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  25.69 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.14 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1328  thiredoxin  21.88 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.64 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  26.43 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  27.64 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.47 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  26.25 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  27.56 
 
 		 203 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  24.06 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.2 
 
 		 382 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1163  conserved hypothetical protein, possible lipoprotein thioredoxin  25.36 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  23.08 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  27.83 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  25.85 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  23.48 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  26.15 
 
 		 168 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.21 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>