More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1427 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  90.99 
 
 		 431 aa  803    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  82.94 
 
 		 423 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  83.89 
 
 		 423 aa  733    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  83.89 
 
 		 423 aa  733    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 432 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  99.31 
 
 		 432 aa  876    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  83.41 
 
 		 423 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  96.53 
 
 		 432 aa  856    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  83.65 
 
 		 423 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  66.59 
 
 		 421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  61.74 
 
 		 421 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  62.17 
 
 		 425 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  59.67 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  62.95 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  59.18 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  59.53 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.1 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.08 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.96 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.18 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.18 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.18 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.22 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.22 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.22 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.22 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  52.22 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.22 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.72 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.96 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.72 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.97 
 
 		 422 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  52.22 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.96 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.22 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.96 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  50.86 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50.37 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  50.98 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  50.86 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  44.74 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  45.31 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  45.34 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  43.69 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  44.26 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  46.08 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  43.75 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  41.92 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  42.56 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  41.53 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  42.82 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  44.68 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  41.85 
 
 		 416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  46.04 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  41.85 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.13 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  42.73 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.93 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  43.5 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  44.13 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.91 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  42.96 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  43.93 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  45.63 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  42.22 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  45.39 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  44.9 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  42.72 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  43.57 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  43.57 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  43.72 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  42.24 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  43.91 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  42.69 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  43.49 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  43.49 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  43.49 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  44.77 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  40.49 
 
 		 436 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  43.58 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  43.35 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  43.58 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  42.66 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.49 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  40.78 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.62 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  44.77 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  41.27 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  42.79 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  42.46 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  42.46 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  42.46 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  42.46 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.46 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  42.79 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  40.52 
 
 		 441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  43.78 
 
 		 423 aa  303  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  43.86 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  43.54 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  42.72 
 
 		 448 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>