36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1252 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  99.52 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  99.05 
 
 		 210 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  90.95 
 
 		 210 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  84.76 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  83.81 
 
 		 210 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  84.29 
 
 		 210 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  83.81 
 
 		 210 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  83.33 
 
 		 210 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  50.48 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  54.69 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  53.33 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  49.28 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  44.55 
 
 		 210 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  41.03 
 
 		 236 aa  168  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  49.45 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  25.38 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  26.46 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  24.37 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  34.51 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  30.67 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  27.48 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  25.76 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  25.79 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  25.87 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  25.17 
 
 		 260 aa  51.6  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  24.43 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  24.8 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  23.84 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  27.01 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  20.71 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  23.66 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  28.21 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  24.77 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>