84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1574 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188511  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2858  hypothetical protein  98.86 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1710  hypothetical protein  94.32 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000109022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2753  hypothetical protein  94.32 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2674  hypothetical protein  94.32 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2639  hypothetical protein  94.32 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2372  hypothetical protein  93.18 
 
 		 88 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.810646  hitchhiker  0.000114993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2359  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  166  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2839  hypothetical protein  90.91 
 
 		 88 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.82179  hitchhiker  0.0000856342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1695  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1546  hypothetical protein  90.91 
 
 		 88 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1745  hypothetical protein  88.64 
 
 		 88 aa  163  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.588903  hitchhiker  0.0000483214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1522  hypothetical protein  82.95 
 
 		 88 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0262  hypothetical protein  70.45 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2277  hypothetical protein  69.32 
 
 		 88 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2827  hypothetical protein  67.05 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00720  hypothetical protein  67.05 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0524  hypothetical protein  62.5 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002208  hypothetical protein  56.32 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00159  hypothetical protein  54.02 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2480  putative solute symporter protein  61.73 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.029038 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1650  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00520982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3156  Maf-like protein  59.74 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0487  hypothetical protein  61.73 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0195334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1793  hypothetical protein  55.95 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000127525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3405  hypothetical protein  55.42 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760954  normal  0.315364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4789  hypothetical protein  53.01 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1770  hypothetical protein  52.22 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0986234  normal  0.427935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1864  putative solute symporter protein  51.76 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0698534  normal  0.307528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0087  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2253  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.935196  normal  0.0501175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0872  hypothetical protein  51.19 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.38299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1440  hypothetical protein  52.38 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4953  hypothetical protein  57.14 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1959  hypothetical protein  49.43 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0280  membrane protein-like protein  53.01 
 
 		 86 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2230  hypothetical protein  52.38 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273164  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0577  hypothetical protein  52.38 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1262  hypothetical protein  47.62 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0702268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0508  membrane protein-like protein  53.57 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2051  Maf-like protein  52.44 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342839 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3665  hypothetical protein  54.22 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3838  hypothetical protein  51.19 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3755  hypothetical protein  51.19 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3697  hypothetical protein  51.19 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0556  hypothetical protein  55.13 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3555  hypothetical protein  49.4 
 
 		 85 aa  84.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0901  hypothetical protein  52.5 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.703868  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4551  hypothetical protein  47.62 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1176  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4039  putative solute symporter protein  48.75 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1041  membrane protein  61.04 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0318  hypothetical protein  49.4 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00269731  hitchhiker  0.00788498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0631  hypothetical protein  47.44 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4102  membrane protein-like protein  49.37 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1299  membrane protein  50 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.863066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3461  membrane protein-like protein  45.68 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000680591  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5742  putative solute symporter protein  50.68 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3833  membrane protein  50.63 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.536523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1265  hypothetical protein  38.27 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2263  membrane protein-like protein  41.86 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1629  membrane protein-like protein  42.86 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.604047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1497  hypothetical protein  41.77 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.021579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3138  membrane protein-like protein  39.29 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1638  membrane protein  38.27 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1524  membrane protein  33.73 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.261907  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  41.33 
 
 		 729 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3040  hypothetical protein  36.59 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4145  membrane protein-like  33.33 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257002  normal  0.0353718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0865  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0675484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  36.49 
 
 		 759 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3112  hypothetical protein  33.8 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985689  decreased coverage  0.0000131927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0463  hypothetical protein  29.63 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  43.94 
 
 		 769 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1417  membrane protein  32.88 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0524  hypothetical protein  30.26 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1023  membrane protein  28.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.451151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2229  membrane protein-like protein  35.06 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2108  membrane protein-like protein  35.06 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2016  hypothetical protein  39.34 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1086  membrane protein-like protein  32.47 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2397  hypothetical protein  25.32 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>