35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1314 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  91.9 
 
 
210 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  85.24 
 
 
210 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  84.76 
 
 
210 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  84.29 
 
 
210 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  84.29 
 
 
210 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  83.81 
 
 
210 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  50.48 
 
 
209 aa  224  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  54.17 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  53.33 
 
 
208 aa  218  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  48.79 
 
 
208 aa  191  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  44.08 
 
 
210 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  40.6 
 
 
236 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  27.06 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  24.87 
 
 
212 aa  89  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  25.93 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  23.86 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  23.98 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  33.8 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  30 
 
 
254 aa  82  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  27.48 
 
 
258 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  25.25 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  25.87 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  24.53 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  24.5 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  23.86 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  24 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  26.28 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  20.71 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  22.52 
 
 
187 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  23.66 
 
 
342 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>