42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3697 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3697  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 390 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3932  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  51.22 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2557  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.43 
 
 		 346 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.93 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0548  glycosyl transferase family 9  23.27 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0259889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.05 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.57 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.57 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.58 
 
 		 344 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.5 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.57 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.29 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.29 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.29 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.29 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.78 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.07 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.26 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.99 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.26 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  20.41 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.4 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1411  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  18.6 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.48 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.8 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.16 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.94 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  22.26 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.1 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.1 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.94 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  23.5 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.24 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.65 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.12 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>