More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2252 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2252  anthranilate synthase component II  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2913  anthranilate synthase component II  86.07 
 
 		 201 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970253  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1685  anthranilate synthase component II  82.59 
 
 		 201 aa  337  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1428  anthranilate synthase component II  79 
 
 		 211 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2451  anthranilate synthase component II  83.25 
 
 		 240 aa  333  7.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1589  anthranilate synthase component II  80.9 
 
 		 204 aa  332  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2404  anthranilate synthase component II  80.83 
 
 		 200 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2723  anthranilate synthase component II  80.31 
 
 		 200 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2802  anthranilate synthase component II  80.31 
 
 		 200 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1663  anthranilate synthase component II  80.31 
 
 		 200 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0146464  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2702  anthranilate synthase component II  79.79 
 
 		 207 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2130  anthranilate synthase component II  79.58 
 
 		 199 aa  314  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1461  anthranilate synthase component II  81.87 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1519  anthranilate synthase component II  81.35 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1527  anthranilate synthase component II  81.87 
 
 		 202 aa  297  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452213  normal  0.0147223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3020  anthranilate synthase component II  80.21 
 
 		 202 aa  294  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3523  glutamine amido-transferase  58.03 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2173  anthranilate synthase component II  56.38 
 
 		 192 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1153  anthranilate synthase component II  57.75 
 
 		 202 aa  217  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2830  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.85 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2043  anthranilate synthase component II  56.38 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1933  anthranilate synthase component II  56.38 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  213  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2668  anthranilate synthase component II  54.26 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0795  anthranilate synthase component II  55.32 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2305  anthranilate synthase component II  55.32 
 
 		 192 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2006  anthranilate synthase component II  55.32 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 531 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1933  anthranilate synthase component II  54.26 
 
 		 192 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02289  glutamine amido-transferase  53.3 
 
 		 210 aa  208  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02759  anthranilate synthase component II  50.52 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1059  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  52.08 
 
 		 200 aa  208  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 		 531 aa  208  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003087  anthranilate synthase amidotransferase component  51.04 
 
 		 202 aa  207  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.48 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  48.4 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  49.74 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  48.7 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.37 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  48.94 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  47.69 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.18 
 
 		 204 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  48.94 
 
 		 188 aa  175  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  47.98 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  48.45 
 
 		 192 aa  175  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  48.19 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  48.4 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.67 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.96 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  49.48 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  49.48 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.67 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  47.34 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  48.94 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  49.74 
 
 		 187 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.4 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  48.68 
 
 		 188 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  48.4 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  50 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.34 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  47.67 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  46.67 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  49.48 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 		 187 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  46.81 
 
 		 187 aa  168  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0549  Para-aminobenzoate synthase, glutamine amidotransferase component  47.42 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.481962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.77 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.65 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.65 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.65 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.08 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  48.44 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  46.74 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  48.44 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  46.7 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  48.44 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  45.41 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>