18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0163 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0167  hypothetical protein  95.08 
 
 
386 aa  752    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0980285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4192  hypothetical protein  96.11 
 
 
386 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0163  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0165  hypothetical protein  70.21 
 
 
388 aa  534  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3553  hypothetical protein  68.49 
 
 
390 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.912743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0181  hypothetical protein  35.91 
 
 
348 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3189  hypothetical protein  32.37 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0672  hypothetical protein  29.01 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5010  hypothetical protein  27.73 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5907  hypothetical protein  25.08 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234146  normal  0.772343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1919  hypothetical protein  26.33 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120292  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4256  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.24 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168829  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2873  hypothetical protein  29.89 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.789287  hitchhiker  0.000633681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0164  hypothetical protein  27.06 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3222  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  24.31 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  23.22 
 
 
584 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4877  hypothetical protein  29.45 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3493  hypothetical protein  26.27 
 
 
404 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809088  normal  0.354813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>