23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25710 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  47.94 
 
 
193 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  43.23 
 
 
209 aa  165  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  40.72 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  41.45 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23140  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  41.03 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.541294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  36.27 
 
 
215 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  36.46 
 
 
212 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  33 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  35.75 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  31 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  30.61 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  29.08 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1769  hypothetical protein  27.08 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  27.18 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00740  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  26.42 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.603366  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1435  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185215  normal  0.679893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3089  hypothetical protein  27.55 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  26.9 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  25.38 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  28.5 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  24.63 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0907  hypothetical protein  24.1 
 
 
198 aa  41.2  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>