20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  478  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  57.21 
 
 
216 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  56.36 
 
 
232 aa  230  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  44.04 
 
 
240 aa  154  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13410  hypothetical protein  41.35 
 
 
261 aa  148  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  41.18 
 
 
172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  37.67 
 
 
186 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  26.67 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.33 
 
 
589 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  27.78 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  31.45 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  31.75 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  41.46 
 
 
122 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  38.24 
 
 
598 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0987  flavocytochrome c  37.5 
 
 
148 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  46.81 
 
 
591 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  34.34 
 
 
596 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  34.34 
 
 
596 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  34.34 
 
 
596 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  34.34 
 
 
596 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>