More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02590  AAA+ family ATPase  100 
 
 		 388 aa  795    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.425003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03320  AAA+ family ATPase  37.16 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  39.5 
 
 		 1110 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  38.71 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  38.39 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  35.96 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  39.6 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  39.6 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  38.82 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  37.05 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  36.16 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  38.37 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  39.02 
 
 		 1930 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  38.56 
 
 		 1105 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  37.83 
 
 		 678 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  37.87 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  37.33 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  40.59 
 
 		 564 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  41.54 
 
 		 855 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  39.51 
 
 		 839 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  33.84 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  33.84 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  40.2 
 
 		 541 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  38.81 
 
 		 617 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 308 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  36.96 
 
 		 317 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  34.44 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  36.16 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  38.54 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  36.63 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  36.55 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  37.28 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 596 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  37.98 
 
 		 301 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  37.31 
 
 		 310 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  38.92 
 
 		 466 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  36.12 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  33.68 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  40.3 
 
 		 664 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  38.6 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  35.85 
 
 		 329 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  36.14 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  39.11 
 
 		 681 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  36.14 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  36.95 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  36.95 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  38.43 
 
 		 366 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.78 
 
 		 312 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  32.46 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  37.67 
 
 		 310 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  36.08 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  38.31 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  31.89 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  37.93 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  32.32 
 
 		 505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  31.18 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  37.93 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  37.44 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  31.23 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  34.82 
 
 		 344 aa  130  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  35.44 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  36.1 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  34.96 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  33.97 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  35.62 
 
 		 653 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  33.97 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0636  AAA ATPase central domain-containing protein  34.43 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  34.8 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  40.09 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  36.41 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  35.17 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1657  CbbX protein  35.44 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  32.37 
 
 		 846 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  35.29 
 
 		 487 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  36.07 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  34.63 
 
 		 1133 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  29.89 
 
 		 550 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  34.72 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  31.62 
 
 		 823 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  31.3 
 
 		 593 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  36.04 
 
 		 819 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  33.58 
 
 		 779 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 		 573 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  32.9 
 
 		 573 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  29.35 
 
 		 573 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 		 573 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  32.66 
 
 		 780 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  29.73 
 
 		 631 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 		 2310 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  36.84 
 
 		 591 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5463  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 		 599 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>