24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2035 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2035  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1936  hypothetical protein  55.84 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33460  general glycosylation protein  53.57 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2759  hypothetical protein  40.57 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.474468  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0057  general glycosylation pathway protein  35.17 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3535  hypothetical protein  34.72 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0651  hypothetical protein  38.95 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3768  hypothetical protein  38.3 
 
 		 315 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3768  hypothetical protein  38.54 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0541  hypothetical protein  32.68 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3489  hypothetical protein  32.68 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0540  hypothetical protein  34.69 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0500  hypothetical protein  38.54 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3950  hypothetical protein  38.54 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3824  hypothetical protein  38.54 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1766  general glycosylation pathway protein  29.66 
 
 		 301 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1675  hypothetical protein  31.52 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.877209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0602  general glycosylation pathway protein  32.67 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1137  general glycosylation pathway protein  32.67 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2932  hypothetical protein  26.39 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000232307  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1262  general glycosylation pathway protein  32.67 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0771  hypothetical protein  25.2 
 
 		 287 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0166  hypothetical protein  32.2 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.604239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4230  hypothetical protein  27.33 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081748  normal  0.422268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>