150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0572 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00463  predicted uracil/xanthine transporter  78.97 
 
 		 433 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0614  putative purine permease YbbY  78.97 
 
 		 433 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3100  Xanthine/uracil/vitamin C permease  79.21 
 
 		 433 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0631  putative purine permease YbbY  99.54 
 
 		 432 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0577  putative purine permease YbbY  99.77 
 
 		 432 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0586  putative purine permease YbbY  79.21 
 
 		 433 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0570  putative purine permease YbbY  99.77 
 
 		 432 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0550  putative purine permease YbbY  78.74 
 
 		 433 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00468  hypothetical protein  78.97 
 
 		 433 aa  685    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3110  putative purine permease YbbY  79.21 
 
 		 433 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.39747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0572  putative purine permease YbbY  100 
 
 		 432 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0012  xanthine/uracil permease family protein  27.55 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4913  xanthine/uracil/vitamin C permease  27.63 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4627  xanthine/uracil permease family protein  26.54 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.124277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0625  xanthine permease  26.16 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4239  xanthine/uracil permease family protein  26.39 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4725  xanthine/uracil permease family protein  26.39 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.536071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4386  xanthine/uracil permease family protein  26.39 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.694966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4227  xanthine/uracil permease family protein  26.09 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5574  xanthine/uracil permease family protein  28.51 
 
 		 427 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4630  xanthine/uracil permease family protein  26.54 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4330  xanthine/uracil/vitamin C permease  25.17 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4604  xanthine/uracil permease family protein  26.39 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5524  xanthine/uracil permease family protein  28.28 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5188  xanthine/uracil/vitamin C permease  29.17 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5518  xanthine/uracil permease family protein  28.27 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4601  xanthine/uracil permease family protein  26.05 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5247  xanthine/uracil permease family protein  28.27 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5433  xanthine/uracil permease family protein  28.28 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5645  xanthine/uracil permease family protein  28.27 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5490  xanthine/uracil permease family protein  28.27 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3916  xanthine/uracil/vitamin C permease  28.57 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5076  xanthine/uracil permease family protein  28.27 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000323201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5093  xanthine/uracil permease family protein  28.27 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4610  xanthine permease  25.93 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2262  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.06 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000390062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0770  Xanthine/uracil/vitamin C permease  23.57 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1236  xanthine/uracil/vitamin C permease  24.19 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  21.56 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  23.34 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  23.54 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  23.54 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  23.02 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  22.94 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  23.09 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  25.68 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0808  xanthine/uracil/vitamin C permease  24.55 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  22.85 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2514  xanthine/uracil/vitamin C permease  22.76 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  22.22 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  23.04 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  22.39 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  23.78 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  23.31 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  23.46 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  22.78 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  19.7 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2967  xanthine permease  24.16 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  22.22 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  23.45 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  24.15 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0933  xanthine/uracil permease  22.27 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  22.62 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  22.6 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  23.27 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  23.34 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  26.27 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  23.27 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  22.45 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  25.46 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  21.89 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  25.46 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  22.45 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  25.46 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  25.46 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  25.46 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  21.94 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  22.96 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  22.96 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  27.74 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  26.51 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  24.13 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  22.96 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  22.93 
 
 		 465 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  24.65 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  22.37 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  24.65 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  23.01 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  22.22 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  20.81 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  22.15 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>