100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2337 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  66.89 
 
 		 592 aa  866    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  63.98 
 
 		 594 aa  815    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  67.72 
 
 		 596 aa  885    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  60.17 
 
 		 594 aa  796    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  100 
 
 		 604 aa  1248    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  66.23 
 
 		 595 aa  859    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  67.38 
 
 		 596 aa  859    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  66.39 
 
 		 595 aa  861    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  67.88 
 
 		 596 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  61.9 
 
 		 595 aa  800    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  67.88 
 
 		 596 aa  888    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  59.6 
 
 		 594 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  68.38 
 
 		 596 aa  887    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  66.56 
 
 		 595 aa  863    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  62.05 
 
 		 595 aa  776    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  66.39 
 
 		 595 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  33.39 
 
 		 601 aa  356  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  32.68 
 
 		 602 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  32.89 
 
 		 600 aa  346  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  32.68 
 
 		 602 aa  340  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  30.69 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  30.69 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  30.69 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  32.24 
 
 		 593 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  29.77 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  29.49 
 
 		 586 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  29.49 
 
 		 586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  30.15 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  30.15 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  30.16 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  30.15 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  30.15 
 
 		 586 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  31.25 
 
 		 595 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  29.41 
 
 		 586 aa  280  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  29.32 
 
 		 582 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  29.69 
 
 		 580 aa  273  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  29.59 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  29.4 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  29.89 
 
 		 582 aa  264  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.59 
 
 		 617 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.59 
 
 		 617 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  29.37 
 
 		 615 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  28.2 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  27.22 
 
 		 622 aa  206  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  27.29 
 
 		 611 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  25.89 
 
 		 600 aa  196  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  27.42 
 
 		 609 aa  183  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.59 
 
 		 637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  24.81 
 
 		 647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  25.39 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  28.66 
 
 		 586 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.42 
 
 		 637 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  25.13 
 
 		 607 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  27.38 
 
 		 607 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  27.1 
 
 		 635 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  27.1 
 
 		 638 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  27.33 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  27.1 
 
 		 509 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  28.86 
 
 		 508 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.33 
 
 		 624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  26.82 
 
 		 614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  25.31 
 
 		 642 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  24.53 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  23.17 
 
 		 630 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.14 
 
 		 621 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  22.99 
 
 		 621 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  22.99 
 
 		 621 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  23.26 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  24.02 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  23.27 
 
 		 630 aa  53.9  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  23.67 
 
 		 517 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  23.67 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  23.67 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  23.67 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  23.67 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  29.52 
 
 		 517 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  23.67 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  28.7 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  21.09 
 
 		 672 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  30.53 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  21.64 
 
 		 712 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  27.78 
 
 		 1009 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  30.43 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  30 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  26.09 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  29.89 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.57 
 
 		 537 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  29.89 
 
 		 516 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  29.89 
 
 		 516 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  29.89 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  29.89 
 
 		 511 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  29.89 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  29.89 
 
 		 511 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  28.97 
 
 		 873 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>