64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1909 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  100 
 
 
295 aa  587  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  42.95 
 
 
282 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  34.2 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  26.51 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  32.65 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  30.65 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  28.74 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  33.65 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  31.97 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  27.98 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  32.14 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  29.13 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  38 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  29.25 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  28.64 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  30.23 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  36.59 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  30.73 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  29.54 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  28 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  26.3 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  27.57 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  24.2 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.36 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  26.69 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  29.45 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  25.82 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  27.6 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  26.41 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  28.05 
 
 
336 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  33.1 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  32.39 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  29.15 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  32.6 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  25.89 
 
 
314 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  25.89 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  25.89 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  25.89 
 
 
314 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  25.89 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  31.62 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  29.28 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  26.94 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  28.89 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  24.56 
 
 
433 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  26.62 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  25.4 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  35.64 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  37.36 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  33.98 
 
 
528 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  24.28 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5069  abortive infection protein  29.33 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  24.69 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  26.14 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  23.74 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  23.74 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  23.65 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  24.68 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  28.18 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  25.11 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  23.38 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  24.56 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  22.66 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  25.14 
 
 
226 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>