67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1762 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  100 
 
 		 95 aa  197  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  35.05 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  35.48 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  35.48 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  35.48 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  31.91 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  33.7 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  33.7 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  35.37 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  35.37 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  33.33 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  32.61 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  32.61 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  32.61 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  34.18 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  32.61 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  27.37 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  30.85 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  32.61 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  29.79 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  31.51 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  32.93 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  29.07 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  31.51 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  34.85 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  31.71 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  26.32 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  26.32 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  34.25 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  28.77 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  31.71 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  27.08 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  30.53 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  29.21 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  27.08 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  33.73 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  27.96 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  29.79 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  42.55 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  42.55 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  33.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  25.81 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  25.93 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  29.76 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  22.22 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  27.59 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  38.3 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  27.38 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  26.04 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  26.19 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  24.1 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  27.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  28.12 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  24.47 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  30.56 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  24.69 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  23.08 
 
 		 94 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  22.68 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  24.24 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  26.25 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  24.66 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>