More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1269 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02400  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 488 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00346378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1160  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 488 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000565668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1127  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.41 
 
 		 487 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00407073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.4 
 
 		 487 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.61 
 
 		 490 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.14 
 
 		 515 aa  762    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2659  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 488 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.42 
 
 		 488 aa  911    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.03 
 
 		 488 aa  916    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  76.8 
 
 		 487 aa  751    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.42 
 
 		 488 aa  911    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1169  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 488 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00303448  normal  0.0122291 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  64.89 
 
 		 490 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  64.68 
 
 		 490 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2767  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.48 
 
 		 488 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.21 
 
 		 488 aa  909    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2792  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 488 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  63.71 
 
 		 486 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02973  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  69.96 
 
 		 446 aa  636    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2657  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 511 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000195261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.2 
 
 		 486 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2876  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.48 
 
 		 488 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.31 
 
 		 489 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  94.06 
 
 		 488 aa  922    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2883  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 488 aa  724    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.69 
 
 		 488 aa  764    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02362  hypothetical protein  78.28 
 
 		 488 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00275672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.3 
 
 		 556 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2745  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.48 
 
 		 488 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00565207  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.51 
 
 		 486 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3732  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.28 
 
 		 503 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000579162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 488 aa  991    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.42 
 
 		 488 aa  911    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.82 
 
 		 487 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.4 
 
 		 485 aa  694    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.14 
 
 		 487 aa  763    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3124  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  89.59 
 
 		 490 aa  856    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  76.43 
 
 		 488 aa  747    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.53 
 
 		 489 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.41 
 
 		 487 aa  754    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2704  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.48 
 
 		 488 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  76.8 
 
 		 487 aa  790    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.24 
 
 		 488 aa  919    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.65 
 
 		 488 aa  922    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.24 
 
 		 488 aa  927    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  76.8 
 
 		 489 aa  771    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3004  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.07 
 
 		 488 aa  741    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00999222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  90.2 
 
 		 490 aa  903    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.75 
 
 		 494 aa  634    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  89.59 
 
 		 490 aa  900    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.03 
 
 		 488 aa  917    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.14 
 
 		 487 aa  763    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2660  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.48 
 
 		 488 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000716462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  75.77 
 
 		 487 aa  745    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  88.93 
 
 		 488 aa  875    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  91.17 
 
 		 488 aa  890    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2950  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.93 
 
 		 488 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645163  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.58 
 
 		 490 aa  633  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 487 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.19 
 
 		 488 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.12 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.27 
 
 		 486 aa  622  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.15 
 
 		 486 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.51 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.86 
 
 		 487 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.94 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.06 
 
 		 486 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 489 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.94 
 
 		 490 aa  614  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.65 
 
 		 487 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.42 
 
 		 514 aa  616  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.94 
 
 		 490 aa  614  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.65 
 
 		 487 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1031  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.33 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1449  inosine-5-monophosphate dehydrogenase  65.71 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.03 
 
 		 487 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.33 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.44 
 
 		 486 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.27 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1346  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1029  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 489 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 		 487 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.29 
 
 		 491 aa  614  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15310  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10306  hitchhiker  4.2499e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1035  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.39 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.27 
 
 		 486 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 		 486 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.17 
 
 		 488 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 		 489 aa  611  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.06 
 
 		 487 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.24 
 
 		 486 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.24 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.03 
 
 		 486 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>