13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0803 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0803  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  714    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.12 
 
 		 614 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>