More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0037 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1275  16S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 1513 bp  1590    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1524  16S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 1513 bp  1590    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1800  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1511 bp  1370    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SA  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1513 bp  1598    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SB  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1513 bp  1598    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SC  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1513 bp  1598    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0055  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1497 bp  2960    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0042  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1711  16S ribosomal RNA  88.97 
 
 		 1511 bp  1586    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1724  16S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 1513 bp  1618    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1803  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1511 bp  1370    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0148502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1806  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1511 bp  1370    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0592  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1461 bp  1558    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0506  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1461 bp  1558    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.213034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1704  16S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 1513 bp  1618    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0032  16S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 1513 bp  1590    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0037  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0018  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1448 bp  1253    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0022  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1448 bp  1253    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0031  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1448 bp  1253    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0059  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1448 bp  1253    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0517  16S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 1513 bp  1618    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.635993  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0460  16S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 1513 bp  1618    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2342  16S ribosomal RNA  88.94 
 
 		 1458 bp  1515    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r04  16S ribosomal RNA  89.44 
 
 		 1723 bp  1419    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r01  16S ribosomal RNA  89.44 
 
 		 1723 bp  1419    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1465  16S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 1513 bp  1618    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r06  16S ribosomal RNA  89.44 
 
 		 1723 bp  1419    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2339  16S ribosomal RNA  88.94 
 
 		 1458 bp  1515    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.474601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2336  16S ribosomal RNA  88.94 
 
 		 1458 bp  1515    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0152  16S ribosomal RNA  88.96 
 
 		 1461 bp  1558    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0018  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1585 bp  480  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0050  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1610 bp  480  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26753  hitchhiker  0.000883361 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0058  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1610 bp  480  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0063  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1610 bp  480  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.637645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0019  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1586 bp  480  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.469042  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0052  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1586 bp  480  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84843  hitchhiker  0.00924984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0060  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1586 bp  480  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0065  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1586 bp  480  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.473694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0059  16S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 1547 bp  470  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00900498  hitchhiker  0.000470771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0064  16S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 1547 bp  470  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000356751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0074  16S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 1547 bp  470  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.18727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0069  16S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 1547 bp  470  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000561178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0014  16S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 1547 bp  470  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0215019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 1491 bp  464  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 1491 bp  464  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  81.99 
 
 		 1548 bp  438  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  81.99 
 
 		 1548 bp  438  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  82 
 
 		 1540 bp  434  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  82 
 
 		 1540 bp  434  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  82 
 
 		 1540 bp  434  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  82 
 
 		 1540 bp  434  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1551 bp  422  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1551 bp  422  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1551 bp  422  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1551 bp  422  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0053  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1531 bp  414  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0058  16S ribosomal RNA  81.22 
 
 		 1531 bp  414  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 		 1473 bp  400  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 		 1473 bp  400  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0008  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1548 bp  398  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  hitchhiker  0.000712257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0074  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1537 bp  398  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0082  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1537 bp  398  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000564092  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0034  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1548 bp  398  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000185236  normal  0.225155 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0076  16S ribosomal RNA  82.1 
 
 		 1476 bp  394  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0044  16S ribosomal RNA  82.1 
 
 		 1476 bp  394  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418237  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0029  16S ribosomal RNA  82.1 
 
 		 1476 bp  394  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392184  hitchhiker  0.00162521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0051  16S ribosomal RNA  82.1 
 
 		 1476 bp  394  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  0.139607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0013  16S ribosomal RNA  81.96 
 
 		 1476 bp  387  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0073  16S ribosomal RNA  81.96 
 
 		 1476 bp  387  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0620583  hitchhiker  0.00094865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4846  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1497 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0811  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1497 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5403  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1497 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00231209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08570  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1526 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337059  hitchhiker  0.00000000146404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55637  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1526 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00734417  normal  0.40979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62090  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1526 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116263  normal  0.0197607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70910  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1526 bp  383  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.135781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0044  16S ribosomal RNA  80.97 
 
 		 1528 bp  379  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.256781  normal  0.169307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6153  16S ribosomal RNA  82.93 
 
 		 1497 bp  375  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  82.84 
 
 		 1542 bp  375  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  82.84 
 
 		 1542 bp  375  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1535 bp  373  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0073  16S ribosomal RNA  82.71 
 
 		 1542 bp  373  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1535 bp  373  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0011  16S ribosomal RNA  82.71 
 
 		 1542 bp  373  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0069  16S ribosomal RNA  80.62 
 
 		 1526 bp  369  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000248353  normal  0.741458 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0079  16S ribosomal RNA  80.62 
 
 		 1526 bp  369  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232909  normal  0.0762445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0019  16S ribosomal RNA  80.62 
 
 		 1526 bp  369  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000989523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0004  16S ribosomal RNA  80.62 
 
 		 1526 bp  369  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000423503  hitchhiker  0.00389756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0072  16S ribosomal RNA  80.62 
 
 		 1526 bp  369  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000672312  normal  0.125016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1496 bp  363  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1497 bp  363  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 1497 bp  363  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1526 bp  361  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1545 bp  359  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  82.53 
 
 		 1528 bp  359  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1550 bp  359  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1550 bp  359  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1545 bp  359  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  82.5 
 
 		 1518 bp  355  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>