More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0018 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0055  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1497 bp  1261    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0517  16S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 1513 bp  1092    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.635993  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0592  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1461 bp  1076    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0506  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1461 bp  1076    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.213034  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SA  16S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 1513 bp  1078    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SB  16S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 1513 bp  1078    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SC  16S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 1513 bp  1078    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1465  16S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 1513 bp  1092    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0037  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1497 bp  1253    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0042  16S ribosomal RNA  88.93 
 
 		 1497 bp  1253    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0018  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1448 bp  2870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0022  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1448 bp  2870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0031  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1448 bp  2870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0059  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1448 bp  2870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0032  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1513 bp  1070    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0460  16S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 1513 bp  1092    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2342  16S ribosomal RNA  87.26 
 
 		 1458 bp  1084    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2339  16S ribosomal RNA  87.26 
 
 		 1458 bp  1084    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.474601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2336  16S ribosomal RNA  87.26 
 
 		 1458 bp  1084    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1275  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1513 bp  1070    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1524  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1513 bp  1070    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1803  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 1511 bp  872    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0148502  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1704  16S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 1513 bp  1086    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1724  16S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 1513 bp  1086    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1800  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 1511 bp  872    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r04  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1723 bp  1061    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1711  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1511 bp  1055    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r01  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1723 bp  1061    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r06  16S ribosomal RNA  86.63 
 
 		 1723 bp  1061    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1806  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 1511 bp  872    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0152  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1461 bp  1076    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1525 bp  620  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 1525 bp  620  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1518 bp  521  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r04  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1518 bp  521  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00569348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1518 bp  521  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1518 bp  521  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 		 1518 bp  521  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0018  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1585 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0050  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1610 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26753  hitchhiker  0.000883361 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0058  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1610 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0063  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1610 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.637645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0019  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1586 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.469042  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0052  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1586 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84843  hitchhiker  0.00924984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0060  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1586 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0065  16S ribosomal RNA  82.48 
 
 		 1586 bp  511  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.473694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1491 bp  504  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1491 bp  504  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0005  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1479 bp  496  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0008  16S ribosomal RNA  81.38 
 
 		 1479 bp  496  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 1477 bp  494  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 1477 bp  494  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 1477 bp  494  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 1477 bp  494  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0013  16S ribosomal RNA  82.09 
 
 		 1495 bp  490  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000161102  normal  0.413867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0043  16S ribosomal RNA  82.09 
 
 		 1534 bp  490  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000126976  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SA  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1518 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00652559  hitchhiker  0.0000964592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SB  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1518 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  hitchhiker  0.000075441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SC  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1518 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0265668  normal  0.0523023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SE  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1518 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197165  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0056  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000107545  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0013  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000882287  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0058  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000207326  normal  0.764569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0001  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166692  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0001  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1549 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000584792  normal  0.761928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0004  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534371  normal  0.567436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0009  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1549 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805602  hitchhiker  0.000585754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0064  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1538 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000160038  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0031  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1549 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143019  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0018  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1549 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771769  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0014  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000281309  normal  0.538779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0095  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000226987  hitchhiker  0.00000501486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0093  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1538 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000812377  hitchhiker  0.0037636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0099  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000444541  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0021  16S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 1529 bp  482  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  hitchhiker  0.000111868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1556 bp  482  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SD  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1518 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0245595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SF  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1518 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SG  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1518 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0006  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1529 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000203235  hitchhiker  0.00005391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 1551 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 1551 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 1551 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 1551 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA13  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1538 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000640223  normal  0.0141696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA4  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1538 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.17 
 
 		 1526 bp  474  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA83  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1538 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000117688  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0089  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1529 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000457884  normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0080  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1529 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000320741  normal  0.041938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0090  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1529 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1563 bp  474  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1563 bp  474  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0102  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1529 bp  474  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000475362  normal  0.0274728 
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1548 bp  470  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  81.79 
 
 		 1548 bp  470  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA52  16S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 1538 bp  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R1  16S ribosomal RNA  81.74 
 
 		 1527 bp  466  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000539443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>