More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_R0060 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  86.65 
 
 
1542 bp  1195    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  86.65 
 
 
1542 bp  1195    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 
1542 bp  1203    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  86.65 
 
 
1542 bp  1195    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00014  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 
1542 bp  1203    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0514001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  86.72 
 
 
1542 bp  1203    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  86.65 
 
 
1542 bp  1195    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  86.67 
 
 
1530 bp  1193    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  86.67 
 
 
1530 bp  1193    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  86.59 
 
 
1530 bp  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  86.59 
 
 
1530 bp  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  86.59 
 
 
1530 bp  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  86.59 
 
 
1530 bp  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  86.59 
 
 
1530 bp  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SA  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1518 bp  1332    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00652559  hitchhiker  0.0000964592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SB  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1518 bp  1332    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  hitchhiker  0.000075441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SC  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 
1518 bp  1340    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0265668  normal  0.0523023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SD  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1518 bp  1332    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0245595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SE  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 
1518 bp  1340    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197165  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SF  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1518 bp  1332    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SG  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1518 bp  1332    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  86.86 
 
 
1473 bp  1324    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  86.86 
 
 
1473 bp  1324    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  89 
 
 
1518 bp  1160    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r04  16S ribosomal RNA  89 
 
 
1518 bp  1160    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00569348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  89 
 
 
1518 bp  1160    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  89 
 
 
1518 bp  1160    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  89 
 
 
1518 bp  1160    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0018  16S ribosomal RNA  98.99 
 
 
1585 bp  3015    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0050  16S ribosomal RNA  98.99 
 
 
1610 bp  3015    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26753  hitchhiker  0.000883361 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0058  16S ribosomal RNA  98.99 
 
 
1610 bp  3015    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0063  16S ribosomal RNA  98.99 
 
 
1610 bp  3015    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.637645  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R1  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 
1527 bp  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000539443  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R12  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 
1527 bp  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000170255  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R41  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 
1527 bp  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365903  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R60  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 
1527 bp  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000806455  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R81  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 
1527 bp  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231997  normal  0.0102575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R94  16S ribosomal RNA  86.54 
 
 
1527 bp  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000210152  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0013  16S ribosomal RNA  85.68 
 
 
1495 bp  1239    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000161102  normal  0.413867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0043  16S ribosomal RNA  85.91 
 
 
1534 bp  1300    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000126976  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0001  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 
1535 bp  1267    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000556781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0007  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 
1535 bp  1267    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000706702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0107  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 
1535 bp  1267    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0127  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 
1535 bp  1298    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0001  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 
1474 bp  1368    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0011  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 
1474 bp  1368    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000297324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0055  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 
1474 bp  1368    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000172207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0079  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 
1474 bp  1368    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000533753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0087  16S ribosomal RNA  86.93 
 
 
1474 bp  1368    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0019  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1586 bp  3144    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.469042  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0052  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1586 bp  3144    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84843  hitchhiker  0.00924984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0060  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1586 bp  3144    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0065  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1586 bp  3144    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.473694  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  85.99 
 
 
1535 bp  1306    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0071  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 
1535 bp  1322    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0143  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 
1535 bp  1330    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000577207  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0016  16S ribosomal RNA  85.99 
 
 
1535 bp  1306    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00459376  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  86.28 
 
 
1532 bp  1314    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  86.22 
 
 
1532 bp  1306    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1535 bp  1251    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08570  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 
1526 bp  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337059  hitchhiker  0.00000000146404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55637  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 
1526 bp  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00734417  normal  0.40979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62090  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 
1526 bp  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116263  normal  0.0197607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70910  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 
1526 bp  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.135781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0001  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 
1555 bp  1306    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112036  hitchhiker  0.0000014858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0007  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 
1555 bp  1306    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012678  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0016  16S ribosomal RNA  86.16 
 
 
1555 bp  1330    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251895  hitchhiker  0.00000000270434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0069  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 
1555 bp  1291    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00426901  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0120  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 
1555 bp  1291    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0520691  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 
1555 bp  1306    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0136  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 
1555 bp  1283    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000629377  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0140  16S ribosomal RNA  85.96 
 
 
1555 bp  1306    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908549  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0143  16S ribosomal RNA  85.9 
 
 
1555 bp  1298    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.328707  normal  0.910288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0001  16S ribosomal RNA  86.08 
 
 
1537 bp  1332    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00518638  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0004  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 
1537 bp  1340    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000279849  hitchhiker  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0014  16S ribosomal RNA  86.08 
 
 
1537 bp  1332    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000324534  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0019  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 
1537 bp  1340    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000962307  normal  0.557456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0022  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 
1537 bp  1340    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00001194  unclonable  0.0000109151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0050  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 
1537 bp  1340    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0125127  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0112  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 
1537 bp  1340    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000370609  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0132  16S ribosomal RNA  86.08 
 
 
1537 bp  1332    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000703057  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0006  16S ribosomal RNA  87.3 
 
 
1533 bp  1459    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000147722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0016  16S ribosomal RNA  87.23 
 
 
1533 bp  1451    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0059  16S ribosomal RNA  87.09 
 
 
1533 bp  1449    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000114912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 
1538 bp  1174    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 
1538 bp  1181    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0001  16S ribosomal RNA  85.82 
 
 
1537 bp  1291    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000407555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0004  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1537 bp  1346    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000257645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0008  16S ribosomal RNA  85.95 
 
 
1537 bp  1306    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000302643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0022  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1537 bp  1346    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000152089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0073  16S ribosomal RNA  85.95 
 
 
1537 bp  1306    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0117  16S ribosomal RNA  86.27 
 
 
1537 bp  1346    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000829511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>