29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2188 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  55.91 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  56.05 
 
 		 227 aa  234  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  53.85 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  52.04 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  54.13 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  51.58 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  51.58 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  50.91 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  49.07 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  25.1 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  25.42 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  30.65 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  25.67 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  24.33 
 
 		 273 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  24.62 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  22.69 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  24.53 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  24.81 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  26.05 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  25.66 
 
 		 285 aa  48.5  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  25.67 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  24.52 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  24.32 
 
 		 284 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  38.18 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  28.82 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 625 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  22.81 
 
 		 278 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>