27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2087 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  100 
 
 		 452 aa  920    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  33.17 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  33.03 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  33.98 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  32.37 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  31.92 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  30.98 
 
 		 458 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  30.17 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  29.97 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  30.46 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  26.94 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  25 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  25.32 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  22.61 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  21.76 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  28.11 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  28.11 
 
 		 280 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  23.47 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  26.34 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  26.34 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  22.73 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  23.13 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  22.9 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  26.59 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  28.67 
 
 		 367 aa  47  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  28 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  27.81 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>