More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1054 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1054  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  967    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 460 aa  578  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0788  cysteinyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 459 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0413015  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 		 466 aa  568  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0630  cysteinyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.347477  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0893  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0823  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.449834  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1208  cysteinyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 466 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  359  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 494 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 465 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 465 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 465 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 465 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 465 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 455 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 485 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 466 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 479 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  39.01 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 480 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 459 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  40.38 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 481 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 493 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 477 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 487 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>