34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3487 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  759    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  30.84 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  30.23 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  29.39 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0911  hypothetical protein  30.95 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  28.47 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  24.54 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  23.15 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2551  TENA/THI-4 protein  26.11 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  28.95 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1287  hypothetical protein  29.47 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143964  normal  0.0342007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  22.3 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  22.59 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  24.42 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  23.81 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  32.41 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  22.01 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  22.01 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  22.01 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  24.71 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  22.6 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  28.29 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  24.15 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  31.88 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  21.95 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1629  hypothetical protein  24.14 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  22.12 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  23.21 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  27.45 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18820  hypothetical protein  22.17 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0660797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  28.1 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  24.05 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  23.26 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>