30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1982 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  47.06 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  46.43 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  48.33 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  47.46 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  47.06 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  38.18 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  37.5 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  38.18 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  38.18 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  52.5 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  38.18 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  37.74 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0150  cardiolipin synthetase, putative  36.73 
 
 		 509 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.926431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  37.25 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2229  hypothetical protein  34.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  45.65 
 
 		 81 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  48 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  48.08 
 
 		 63 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>