31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0256 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1156    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  61.06 
 
 		 546 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  29.54 
 
 		 569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  30.37 
 
 		 561 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  29.25 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  29.54 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  29.54 
 
 		 546 aa  199  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  28.97 
 
 		 546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  30.11 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  27.56 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  29.51 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  27.18 
 
 		 549 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0393  hypothetical protein  25.71 
 
 		 559 aa  193  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  29.74 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  29.33 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  26.47 
 
 		 550 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  28.85 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4221  hypothetical protein  27.67 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.256943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0927  hypothetical protein  25.43 
 
 		 608 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.943956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  25.39 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5171  putative outer membrane protein  22.34 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  23.62 
 
 		 683 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  28.4 
 
 		 627 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  22.44 
 
 		 428 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25 
 
 		 777 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  32.74 
 
 		 683 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.66 
 
 		 855 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.19 
 
 		 552 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  26.53 
 
 		 844 aa  43.9  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  26.78 
 
 		 692 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  24.64 
 
 		 766 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>