32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2954 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  99.52 
 
 
210 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  98.57 
 
 
210 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  99.05 
 
 
210 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  90.48 
 
 
210 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  84.29 
 
 
210 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  83.81 
 
 
210 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  84.29 
 
 
210 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  82.86 
 
 
210 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  53.37 
 
 
209 aa  231  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  54.69 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  53.33 
 
 
208 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  49.74 
 
 
208 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  46.34 
 
 
210 aa  178  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  50.86 
 
 
236 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  50 
 
 
237 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  27.12 
 
 
214 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  26 
 
 
212 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  30.67 
 
 
254 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  25.25 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  27.95 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  27.95 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  32.39 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  28.24 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  28.28 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  25.26 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  26.45 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  23.53 
 
 
260 aa  52  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  22.14 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  26.5 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  21.47 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  24.09 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>